Qui sommes-nous ?
Les plateformes de génétique moléculaire des cancers en France ont été sollicitées à partir de 2008 pour l’analyse de mutations dans plusieurs tumeurs solides (poumon, côlon, mélanome, ovaire). Les missions se sont étendues depuis sur plusieurs marqueurs.
La génétique somatique des tumeurs a pour but d’identifier les altérations génétiques somatiques dans les tumeurs solides ayant un impact médical. L’analyse de ces altérations est réalisée en complément des analyses d’anatomie pathologiques pour préciser le diagnostic et la classification de la tumeur mais aussi pour aider dans le choix et/ou la surveillance d’un traitement ciblé. De plus en plus de nouvelles thérapies ont des conditions de prescription nécessitant une analyse moléculaire de biomarqueurs de la tumeur dans la perspective d’un traitement ciblé
Le programme Gen&Tiss d’évaluation nationale de la qualité en génétique somatique des tumeurs solides a été lancé en 2012, conjointement par le GFCO (Groupe Francophone de Cytogénomique Oncologique) et l’AFAQAP (Association Française d’Assurance Qualité en Anatomie Pathologique) avec la collaboration de l’Université de Louvain (Belgique), en réponse à un appel à projet de l’Institut National du cancer (INCa).
Basé sur l’analyse d’échantillons fixés et inclus en paraffine issus de la pratique diagnostique, ce programme annuel s’adresse aux plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers et aux laboratoires de biologie ou de pathologie réalisant de tels examens.
L’évaluation des participants porte sur les résultats et l’interprétation des analyses ainsi que sur le contenu des comptes rendus aux cliniciens.
L’anonymisation complète des laboratoires participants est garantie. Chaque participant se verra remettre un rapport de résultats confidentiel avec commentaires individuels.
Les EEQ Gen&Tiss permettent une comparaison nationale inter-laboratoires. Dans une démarche d’amélioration continue des pratiques, des recommandations techniques et organisationnelles sont fournies aux participants sur la base des résultats de ce contrôle externe de la qualité. Dans le cadre de l’accréditation ISO 15189, le programme Gen&Tiss permet aux laboratoires de justifier d’un contrôle qualité externe obligatoire pour accréditer les analyses réalisées.
Plusieurs structures sont
impliquées dans l’organisation
du programme Gen&Tiss :
Association Française d’Assurance Qualité en Anatomie et Cytologie Pathologiques (AFAQAP)
Expérience :
Organisme de contrôles de qualité en anatomopathologie.
Mission dans le projet :
- missions administratives : gestion administrative et financière, gestion de l’anonymat, gestion du site Internet, organisation de la réunion annuelle de restitution des résultats
- missions techniques : préparation et envoi des lots aux participants, assistance aux participants, gestion des demandes d’information
Groupe Francophone de Cytogénomique Oncologique (GFCO)
Expérience :
Association professionnelle destinée à promouvoir l’expertise en génétique somatique.
Missions dans le projet :
coordination du projet, évaluation des résultats
Expérience :
Laboratoire de référence impliqué dans des programmes nationaux et internationaux de médecine personnalisée disposant d’une plateforme de séquençage haut débit dédiée au diagnostic.
Mission dans le projet :
validation du statut moléculaire des échantillons.
Université Catholique de Louvain
Expérience :
Organisation de contrôles de qualité européens (en génétique constitutionnelle et somatique)
Mission dans le projet :
collecte et analyse des réponses des participants, diffusion des résultats du contrôle qualité.
Laboratoire de Pathologie Moléculaire, Hôpital Universitaire de Bruxelles (Belgique)
Expérience :
expertise en biologie moléculaire.
Mission dans le projet :
vérification externe des échantillons de référence et liaison avec les programmes européens.
Plateformes partenaires
Expérience :
Expertise en biologie moléculaire, expertise en anatomie pathologique.
Mission dans le projet :
vérification du statut moléculaire, fourniture des échantillons primaires paraffinés, participation au comité de pilotage.
Plateforme de Génétique Moléculaire des Cancers, services d’Anatomie Pathologique et de Génétique Moléculaire et d’Histocompatibilité, CHRU de Brest
- Pr Cédric LE MARECHAL
- Dr Laurent DOUCET
Laboratoire de Pathologie Clinique et Expérimentale, Hôpital Paasteur, CHU de Nice
- Pr Jean-Christophe SABOURIN
- Dr Aude LAMY
Département de Biopathologie,
Unité de pathologique moléculaire; Centre Jean-Perrin – Clermont-Ferrand
- Pr Frédérique PENAULT-LLORCA
- Dr Cécile AUBE
Laboratoire de génétique somatique des tumeurs – Service de Pathologie, CHU de Rouen
- Pr Paul HOFMAN
- Dr Elodie LONG
- Dr Véronique HOFMAN
Plate-forme de biopathologie
des tumeurs – service de biochimie
et oncogénétique – Paul Brousse –
GH des hôpitaux universitaires
Paris Sud/APHP – Villejuif
- Pr Antoinette LEMOINE
Département de Pathologie
Hôpital Cochin – Paris
- Pr Karen LEROY
- Dr Marie-Luce AURIAULT
Service de Pathologie, Hôpital Ambroise Paré, AP-HP – Boulogne
- Pr Jean-François EMILE
Service de Pathologie, Hôpital Tenon, AP-HP – Boulogne
- Dr Jean-François COTE
Institut Bergonié, Unité de pathologie moléculaire – Bordeaux
- Dr Isabelle SOUBEYRAN
Laboratoire de génétique des tumeurs solides, CHU de Nice
- Dr Florence PEDEUTOUR
- Mme Valérie DURANTON-TANNEUR
- Dr Valérie KUBINIEK
Plateforme de Biologie Moléculaire des Cancers de la Région Nord –
Pas de Calais, Laboratoire de biochimie-biologie moléculaire; CHRU de Lille
- Dr Farid ZERIMECH
- Dr Clotilde DESCARPENTRIES
Laboratoire de Biologie Moléculaire, Département de Biopathologie, Centre Léon Bérard – Lyon
- Dr Véronique HADDAD
Ils ont soutenu le programme Gen&tiss
